硅膠基質液相色譜柱在使用前，進行柱的性能測試，并將結果保存起來，作為今后評價柱性能變化的參考。

但要留意：柱性能可能由于所使用的樣品、活動相、柱溫等條件的差異而有所不同；另外，在做柱性能測試時是按照色譜柱出廠報告中的條件進行，只有這樣，測得的結果才有可比性。

硅膠基質液相色譜柱是樣品組分在柱填料與活動相之間質量交換而達到分離的目的，因此要求活動相具備以下的特點：

a、活動相對樣品具有一定的溶解能力，保證樣品組分不會沉淀在柱中(或長時間保存在柱中)。

b、活動相具有一定惰性，與樣品不產生化學反應(特殊情況除外)。

c、活動相的黏度要盡量小，以便在使用較長的分析柱時能得到好的分離效果；同時降低柱壓降，延長液體泵的使用壽命(可運用進步溫度的方法降低活動相的黏度)。

d、活動相的物化性質要與使用的檢測器相適應。如使用UV檢測器，使用對紫外吸收較低的溶劑配制。

e、活動相沸點不要太低，否則輕易產生氣泡，導致實驗無法進行。

f、在活動相配制好后，一定要進行脫氣。除往溶解在活動相中的微量氣體既有利于檢測，還可以防止活動相中的微量氧與樣品發生作用。